Après avoir obtenu son diplôme, Jean-Marie Magnet a commencé sa carrière professionnelle au sein de Sogeti, société pour la gestion de l’entreprise et le traitement de l’information.
En 1978, il rejoint le groupe IBSI (Intelligent Business System Informatique) à Lyon. En 1983, il est promu Directeur des opérations pour le Nord de la France. Deux ans plus tard, il emménage à Paris et devient Directeur Général du groupe IBSI.
En 1988, Jean-Marie Magnet acquiert deux filiales du groupe IBSI, IBSI Telecam spécialisée dans la sécurité et les réseaux et IBSI Automatismes et Systèmes spécialisée dans l’informatique industrielle et technologique.
Suite à ces acquisitions, il fonde le groupe Ausy dont il en assure la direction.
Le 11 septembre 2013, le Conseil d’administration du groupe Ausy a décidé de dissocier les fonctions de Président du Conseil d’administration et de Directeur général. Jean-Marie Magnet cède sa fonction de Directeur général à Philippe Morsillo et est maintenu Président du Conseil d’administration.